Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp5Q9D7S9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp5Q9D7S9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms