Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Nop56Q9D6Z1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nop56Q9D6Z1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Nop56Q9D6Z1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Nop56Q9D6Z1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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