Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc81Q9D5W4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc81Q9D5W4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms