Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lpcat2bQ9D5U0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Lpcat2bQ9D5U0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Lpcat2bQ9D5U0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lpcat2bQ9D5U0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Lpcat2bQ9D5U0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Lpcat2bQ9D5U0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Lpcat2bQ9D5U0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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