Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3a3Q9D554 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3a3Q9D554 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms