Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S6

Erich6b, Glutamate-rich 6B, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich6bQ9D4S6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Erich6bQ9D4S6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Erich6bQ9D4S6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms