Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms