Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syce1Q9D495 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms