Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sohlh2Q9D489 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms