Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pus10Q9D3U0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pus10Q9D3U0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms