Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snrnp35Q9D384 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snrnp35Q9D384 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms