Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsig1Q9D2J4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms