Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms