Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krtap5-3Q9D226 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap5-3Q9D226 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms