Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SarnpQ9D1J3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SarnpQ9D1J3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms