Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mrpl28Q9D1B9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms