Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1aQ9D132 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms