Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc7Q9D0M0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc7Q9D0M0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms