Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbdc1Q9D0B6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms