Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms