Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc77Q9CZH8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms