Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2fQ9CY34 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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