Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed5Q9CXE7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms