Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yif1bQ9CX30 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms