Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih4Q9CX13 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms