Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx10Q9CWT3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx10Q9CWT3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms