Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
4930524J08RikQ9CUJ5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms