Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NmbQ9CR53 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NmbQ9CR53 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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