Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl28Q9CR40 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl28Q9CR40 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms