Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Polr3kQ9CQZ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms