Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rer1Q9CQU3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rer1Q9CQU3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms