Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PompQ9CQT5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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PompQ9CQT5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PompQ9CQT5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PompQ9CQT5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms