Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trappc2Q9CQP2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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