Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nicn1Q9CQM0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nicn1Q9CQM0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms