Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700029P11RikQ9CQ68 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms