Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
StambpQ9CQ26 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms