Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp3Q9CQ10 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp3Q9CQ10 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
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