Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmc1Q9CPZ8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms