Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW5

Ssr2, Translocon-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr2Q9CPW5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssr2Q9CPW5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssr2Q9CPW5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms