Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP9

Trim16, Tripartite motif-containing protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim16Q99PP9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim16Q99PP9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim16Q99PP9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms