Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GpnmbQ99P91 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GpnmbQ99P91 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms