Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b1Q99NB9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b1Q99NB9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms