Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrrtQ99MR6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrtQ99MR6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms