Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cttnbp2nlQ99LJ0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms