Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99KU6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99KU6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99KU6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99KU6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99KU6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms