Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmp1Q99KU0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms