Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Def8Q99J78 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms