Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tspan1Q99J59 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan1Q99J59 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms