Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Slc8b1Q925Q3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Slc8b1Q925Q3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Slc8b1Q925Q3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Slc8b1Q925Q3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc8b1Q925Q3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc8b1Q925Q3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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