Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sfxn4Q925N1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sfxn4Q925N1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms